Pendant plus d'une décennie, le Reichsmarschall Hermann Goering, bras droit d'Adolf Hitler durant le tristement célèbre Troisième Reich, a rassemblé une collection de milliers d'œuvres d'art qui ont été méticuleusement répertoriées dans un immense catalogue.
Berlin, avril 1945. Le IIIe Reich s'effondre. Les combats font rage dans les rues de la capitale. Hitler, accompagné de ses généraux et de ses plus proches partisans, s'est réfugié dans son bunker, situé dans les sous-sols des jardins de la Chancellerie. À ses côtés, Traudl Junge, la secrétaire particulière du Führer, refuse de l'abandonner. Tandis qu'à l'extérieur la situation se dégrade, Hitler vit ses dernières heures et la chute du régime.
Margaret Ann Jessup et ses camarades sont infirmières dans l'armée américaine au milieu des Philippines, et se retrouvent coincées dans la presqu'île de Bataan avec le reste des troupes abandonnées par le général Douglas MacArthur lors de l'expansion du Japon Showa. Commence pour elles un long calvaire dans des camps pour femmes tenus par l'armée impériale japonaise.
Le film a été réalisé avec du matériel (prise de vues, pellicule) que Jean-Paul Le Chanois a dérobé, en août 1943, à la société Continental-Films dirigée par Alfred Greven, dans laquelle il travaillait comme scénariste. Il avait constitué, dès 1941, au sein de cette société allemande de production de films français, un noyau du « Comité de libération ». Sur dénonciation, il a été recherché par la police française et avait donc décidé de disparaître de Paris. Il a utilisé ce matériel pour filmer des maquisards du Vercors (ce qui deviendra son film, « Au cœur de l'orage »), ainsi que des événements d'août 1944, lors de la libération de Paris.
1943. L'armée allemande, démoralisée, perd de sa superbe sur le front russe. Le colonel Brandt reçoit un nouveau chef de bataillon, le capitaine Stransky, un aristocrate prussien, orgueilleux et opportuniste. Celui-ci s'est engagé dans le seul but de décrocher la Croix de fer. L'ambition de Stransky se heurte rapidement à la rigueur du sergent Steiner, un sous-officier très estimé de ses hommes. De retour d'une bataille, Stransky rédige un rapport fallacieux, tout à son honneur, que Steiner refuse de contresigner. Steiner repart en première ligne. Stransky omet de lui faire parvenir l'ordre de repli du colonel Brandt. Steiner et ses hommes se retrouvent cernés par l'ennemi...
Un sergent allemand se retrouve mêlé à une conspiration contre Hitler qui l'amène à sauver la vie d'un colonel américain.
Nouvelle-Guinée, 1942. L'Australie et le Japon sont en guerre. Le 39e Bataillon reçoit pour mission de sécuriser la piste de Kokoda. A la suite de bombardements, quelques soldats se retrouvent totalement isolés au cœur de la jungle, sans vivres ni moyens de communication. Alors qu'ils tentent de rejoindre leur régiment, la bataille fait rage. Les combats, la faim, les maladies vont décimer le 39e Bataillon...
Inspiré des Mémoires de Sally Perel, "Europa Europa" raconte l'itinéraire d'un jeune juif contraint pendant la guerre d'épouser l'idéologie communiste lorsqu'il fuit en Union soviétique, puis celle du nazisme lorsque les Allemands envahissent l'orphelinat où il est refugié. Il en oublie sa propre identité et, pour sauvegarder sa vie, devient même le meilleur élément d'une école d'élite pour la jeunesse allemande.