Tentés par un prix alléchant en cas de victoire malheureusement, des centaines de joueurs désargentés acceptent de s'affronter lors de jeux pour enfants aux enjeux mortels.
Environ 150 000 personnes en situation irrégulière vivent à Tokyo. Ils ne sont pas reconnus comme des réfugiés et vivent dans de mauvaises conditions. Pour se protéger, les clandestins créent une organisation secrète. Cette organisation comprend une banque à laquelle l'Agence japonaise des services financiers n'est pas associée, un hôpital qui n'est pas autorisé par le ministère japonais de la Santé, du Travail et des Affaires sociales et une force de police pour clandestins appelée "Dias Police". Le seul officier de police de l'organisation est Saki Kubozuka. Son âge et sa nationalité sont inconnus. Saki Kubozuka ne parle pas beaucoup, mais il a un cœur chaleureux et un fort sens de la justice. Il prend soin des faibles et essaie de maintenir l'ordre public.
À la suite d'un accident d'avion, un groupe de lycéennes échoue sur une île déserte. Sur place, il n'y a rien à faire, rien à manger, elles doivent se débrouiller toutes seules ! Mais elles ne se laissent pas abattre pour autant et vont apprendre à trouver de la nourriture (des crabes, des cigales…), faire du feu, construire des pièges et chercher des solutions pour sortir de là…
Un ex-soldat des forces spéciales venge les victimes d'injustices en travaillant pour une organisation secrète qui se fait passer pour une entreprise de taxis.
Une femme doit lutter contre la négligence des institutions de l'État et le harcèlement des médias après la disparition de sa sœur.
Un inspecteur général est un poste chargé de vérifier s'il n'y a pas d'injustice dans les devoirs et la vie privée des policiers. Il a le surnom de "policier dans la police" et est un métier détesté par les policiers. Bien que le personnage principal, Ichiroku, soit un inspecteur général, il intervient également dans les enquêtes.
Jeune lycéenne renfermée et taciturne, Lain Iwakura est confrontée au suicide inexpliqué de Chisa Yomoda, une camarade de classe. Peu de temps après, voilà que Lain reçoit un e-mail provenant de Chisa. Celle-ci lui annonce qu'elle est vivante dans le Wired, que seul son corps est mort et qu'elle a rencontré Dieu. Lain décide alors de se connecter au Wired, le net du futur… Elle va ainsi entendre parler des Knights, une bande de hackers étranges, et pénétrer dans un monde qui va engendrer de multiples questions, au détour d'événements et de rencontres glauques…