Lorsque le jeune David Balfour arrive dans la sombre maison écossaise de son oncle pour réclamer son héritage, son parent tente de le tuer, puis le fait embarquer pour être vendu comme esclave dans les colonies. Heureusement pour le garçon, il se lie d'amitié avec Alan Breck Stewart, qui est en fuite après la défaite de Bonnie Prince Charlie à Culloden. Lorsqu'un capitaine de navire tente de tuer Breck pour son argent, les deux parviennent à atteindre la terre ferme et se dirigent vers Édimbourg, évitant les impitoyables soldats Redcoats en cours de route.
Suzuhara Izumiko est une jeune fille de 15 ans, qui a été élevée et protégée dans un sanctuaire cachée dans les montagnes Kumano. Elle est très timide et détruit tous les appareils électriques qu'elle touche. Quand elle commence à penser à sortir des montagnes afin de rejoindre la ville, son tuteur Sagara Yukimasa l'inscrit dans un lycée de Tokyo et force son fils à servir Izumiko. Miyuki et Izumiko se repoussent mutuellement, mais leur relation commence à changer par un accident survenu lors d'une terrifiante excursion scolaire.