Apprenant que son père a été hospitalisé, Nagomu, le fils d'une famille propriétaire d'une fameuse confiserie à Kyôto, revient chez lui après dix ans d’absence pour reprendre l'affaire familiale. Nagomu est plutôt entousiaste à cette idée, mais on lui demande en fait d'être une figure paternelle pour Itsuka, une jeune fille qui a commencé à travailler à la boutique pendant son absence. De plus, tout le monde s’accorde à penser qu’elle prendra la succession de l’entreprise….
Quelque part, dans la ville de Most City, au deuxième étage d'un vieil immeuble, une maison d'édition publie une revue scientifique mensuelle qui propose des articles sur des événements bizarres ou des phénomènes inexpliqués laissant sans réponse même les scientifiques les plus érudits. Ses employés se composent seulement du séduisant rédacteur en chef, Taro J. Suzuki, auquel se joignent l'assistant Jiro Tanaka (en âge d'aller à l'école primaire) et son chien, Saburo. Un jour, le scientifique Goro Sato leur rend visite pour une consultation, point de départ d'une histoire rocambolesque...
Bloom, une fille ordinaire de la planète Terre, vit une vie normale dans la ville de Gardenia jusqu'au jour où elle rencontre Stella, princesse de la planète Solaria en danger. En allant la secourir, Bloom découvre qu'elle possède des pouvoirs magiques. Stella la persuade de rejoindre Alféa, la plus grande école de fées de tout le royaume. Là-bas, Bloom crée le Winx Club composé de ses quatre amies et camarades de chambre : Stella, Musa, Tecna, et Flora. Elles se lieront ensuite d'amitié avec les Specialistes, Brandon, Riven, Timmy, et Sky, dont elles tomberont amoureuses. Le Winx Club rencontrera également un trio de sorcières de la Tour Nuage : Icy, Darcy et Story, mieux connues sous le nom des Trix. Ces dernières recherchent le pouvoir de la flamme du dragon, et leur quête infernale les opposera au Winx Club. Bloom commence également à lever le voile sur les secrets qui planent sur sa planète, ses parents et ses pouvoirs.
Le plus grand dragonnier d'Upanta disparaît lors d'une bataille déterminante. Sans lui, le monde est condamné. Thaim, un jeune dragonnier, part à sa recherche dans un autre monde : un lieu où les dragons volants et l'aventure n'existe que dans les rêves de Nagi, une jeune lycéenne.
Dans une province chinoise, le démon Heihu s'est libéré de la prison où il était enfermé depuis mille ans. Hua, Tang et Cheng, trois jeunes héros adeptes de l'art ancestral du Kung-Fu, doivent le capturer. Leur amitié et leur courage les aideront à surmonter les obstacles, mais cela ne sera pas sans danger.
Une juge cruelle et vicieuse qui n'exerce son pouvoir que pour elle-même rencontre un détective chaleureux et joyeux qui fait passer les victimes en premier.