Le début se déroule dans le désert. En trouvant une affiche annonçant l’arrivée imminente de Robot Carnival, un garçon semble soudain effrayé et en proie à une grande agitation. Il court avertir son village pour s’enfuir, quand une lourde machine grouillante de robots apparaît et c'est une gigantesque forteresse mobile, se dirigeant droit sur les habitations. Autrefois une magnifique fête foraine, ce n’est plus aujourd’hui qu’un engin de destruction endommagé, rouillé et déglingué.
Takuya Arima est un élève de troisième année au lycée Sakaimachi dont le père, un chercheur, a récemment disparu dans un accident. Alors que les vacances d'été approchent, Takuya reçoit un colis de son père contenant une mystérieuse relique se nommant Reflection Device. En suivant les instructions notées sur la lettre de son père, il se retrouve sur l'îlot Ken no Misaki et fait la rencontre d'une étrange jeune femme le prenant pour un certain "Yu-no". Celle-ci disparait aussitôt après l'avoir embrassé. Par la force des choses, Takuya va voyager à travers divers mondes parallèles dans le but de découvrir la vérité sur l'étrange disparition de ses parents.
Elle, tueuse réputée du XXIe siècle, est devenue la quatrième fille du Général Su, la plus inutile des bonnes à rien. Lui, Altesse Impériale de l'empire Jin, est un tyran démoniaque, froid et doté d'un talent sans égal. Tout le monde sait qu'elle est idiote et bonne à rien, et l'humilie sans compter. Mais lui, le tyran autoritaire, a l'œil averti et décide qu'il ne la lâchera pas, même si sa vie doit en dépendre. Voyons maintenant comment ces deux obstinés vont s'affronter en jouant au chat et à la souris.
Une femme en deuil remonte le temps par magie jusqu'en 1998, où elle rencontre un homme qui ressemble étrangement à son défunt grand amour.