L'histoire de Versailles no Bara se passe à la fin du xviiie siècle en France. Oscar est une jeune femme élevée en garçon par un père excédé de n'avoir que des filles. L'éducation militaire d'Oscar lui permet de devenir le capitaine de la garde royale, chargée de la protection de la jeune dauphine Marie-Antoinette. Aux côtés d'Oscar, il y a André, son ami d'enfance, secrètement amoureux d'elle. Ensemble, ils devront affronter les premiers troubles annonçant la Révolution française.
Satonaka Halu est un joueur de hockey dans l'équipe des Scorpions dont il est capitaine. Et à cause de son engagement dans ce sport, il ne peut considérer l'amour que comme un jeu, aucune relation durable n'est envisageable sans risquer de blesser la femme qu'il aime. Murase Aki est quant à elle, une femme d'affaires qui passe la plupart de son temps à attendre que son fiancé revienne. Celui-ci l'a quitté deux ans plus tôt pour aller étudier l'architecture à l'étranger et, lui a promis qu'à son retour, ils se marieront. Halu et Aki sont opposés dans leur conception de l'amour mais malgré tout, décident de sortir ensemble en attendant que le petit ami d'Aki ne revienne. Mais leur relation est aussi la rencontre entre la rage de vaincre dans un sport violent et l'amour.
En l’an 2019, le Japon, en pleine ère Shôwa, était sur le point de changer d’ère. Mais dans le ciel, une fissure vers une autre dimension est soudainement apparue : s’y trouve le Japon Authentique, un univers parallèle où l’ordre des choses est inversé et où perdure l’ère Shôwa, avec le maintien du militarisme d’autrefois. Le Japon a ainsi subi une invasion, rendue possible grâce à l’usage d’armes à gaz appelées « Genmu » et d’humanoïdes géants appelés « Garan », qui ont rendu obsolète l’armement actuel. Le gouvernement est rapidement tombé, et l’ère Reiwa n’a ainsi jamais commencé.
À Fuuto, plus connue sous le nom de Windy City, des êtres mystérieux appelés Dopants font des ravages en utilisant les dangereuses Mémoires Gaia. Cependant, il existe aussi des justiciers qui utilisent les Mémoires Gaia pour combattre ces criminels. Shôtarô Hidari et son partenaire Philip tiennent une agence de détectives. Ils enquêtent sans relâche sur les crimes commis par les Dopants et les humains transformés en monstres. En dernier recours, ils peuvent aussi se transformer en Kamen Rider W !
Lucifer, Satan et les cinq autres princes de l'enfer sont étudiants à l'Académie royale de Diavolo, où ils s'entraînent pour gouverner le monde des démons. Qu'il s'agisse de suivre des humains ou de tomber amoureux, leurs caprices individuels les amènent chaque jour dans des situations intéressantes ! Leurs bouffonneries les feront-ils expulser, ou l'un de ces frères infâmes l'emportera-t-il ?
Choi Jeong Wu est un simple étudiant peu ouvert d'esprit ayant souvent changé d'école à cause du travail de son père. Meilleure élève de l'école et présidente de sa classe, Yang Ah Yeong est une jeune fille réservée n'exprimant jamais ses sentiments. Im Deok Won est un étudiant très naïf mais gardant toujours le sourire. Aussi surnommé « Ours brun », Lee Yeok Ho est réputé comme étant la terreur du lycée, bien qu'il soit en réalité un être bienveillant ayant pour rêve de devenir boxeur professionnel. Sin Yeong Bok et Lee Won Il appartiennent également au gang du lycée et passent la plupart de leur temps à intimider leur camarades. Jang Hyeon Jin est l'une des meilleurs élèves du lycée et amie d'Ah Yeong, mais elle finira pourtant par éprouver de la jalousie envers cette dernière qui deviendra encore plus populaire grâce à sa relation avec Jeong Wu.
Staz n’est pas un vampire comme les autres. En effet, il ne se nourrit pas de sang et rejette le fait d'être un vampire. Staz est le chef d'un territoire faisant partie du monde des démons. Un jour, une humaine nommée Fuyumi Yanagi atterrit par hasard dans ce mystérieux monde et fait la connaissance de Staz. Malheureusement, la jeune fille se fait dévorer par une plante carnivore et devient un fantôme. Staz décide donc de la ressusciter en partant dans une quête où il rencontrera plusieurs rivaux et ennemis.
La princesse Abricotine est destinée à régner sur le Pays des Fontaines où coule la « Fontaine de Vie », source de toute vie dans le Monde du Bosco. Traquée par des bandits soucieux de s'emparer de ce territoire luxuriant, la Princesse est finalement kidnappée avant son intronisation. Or si elle ne devait pas monter sur le trône avant la prochaine éclipse solaire, la « Fontaine de Vie » s'asséchera à jamais provoquant mort et désolation. Abricotine parvient à envoyer un message de détresse que découvrent les animaux de la forêt. Otto le furet, Fiacre la grenouille et Tutti la tortue décident de porter secours à la princesse à bord d'un vaisseau dirigeable, le Bosco.