Jeune lycéenne renfermée et taciturne, Lain Iwakura est confrontée au suicide inexpliqué de Chisa Yomoda, une camarade de classe. Peu de temps après, voilà que Lain reçoit un e-mail provenant de Chisa. Celle-ci lui annonce qu'elle est vivante dans le Wired, que seul son corps est mort et qu'elle a rencontré Dieu. Lain décide alors de se connecter au Wired, le net du futur… Elle va ainsi entendre parler des Knights, une bande de hackers étranges, et pénétrer dans un monde qui va engendrer de multiples questions, au détour d'événements et de rencontres glauques…
Après avoir découvert un univers parallèle caché à l'intérieur d'un supercalculateur, quatre ados doivent empêcher un dangereux virus de détruire le monde.
Dans un futur proche, les jeux s’affichant sur des écrans sont passés de mode. La technologie VR en immersion domine ce marché, mais parmi la multitude de jeux, un grand nombre sont bien souvent nuls et sans intérêt. Certains ont décidé de s’attaquer à ces jeux, comme Rakuro Hizutome, alias Sunraku, qui se plaît à enchaîner les pires d’entre-eux. Mais cette fois, il a décidé de se lancer dans Shangri-La Frontier, un jeu grand public aux quelques trente millions de membres inscrits ! Des amis en ligne, un univers immense, des rencontres avec des rivaux... Rakuro est loin d’imaginer que sa vie, voire son destin et celui de nombreuses personnes, est sur le point de changer lorsqu’il se lance dans cette aventure…
Hakuno Kishinami se réveille sans aucun souvenir au beau milieu d'une guerre féroce dont l'enjeu est le Saint-Graal. Malgré sa confusion, il doit se battre pour survivre.
La vie d'Asahi s'est terminée en même temps que celle qu’elle avait dans Union, célèbre RPG. Les membres de « Subaru » se sont séparés quand le jeu s'est arrêté après la mort d’Asahi. Six ans plus tard, Haruto, un lycéen, se connecte à une nouvelle version, « Re’Union », et retrouve Asahi. Est-ce un fantôme électronique ? La « promesse » que les amis d'enfance s'étaient faite se réalisera dans le jeu.
L’action se déroule en 200X au moment de la Cyber Révolution. Les habitants de Dentech City sont connectés grâce aux Pets - des terminaux spécifiques - à un réseau informatique dans lequel ils évoluent individuellement à travers des "Net Navi", leurs navigateurs personnels. Chaque Net Navi possède des caractéristiques et des pouvoirs propres. Megaman est celui de Lan , un jeune garçon gradé de la cinquième section. Ensemble et avec leurs amis, ils essaient de contrecarrer le diabolique Mr Wily et son organisation du chaos Net Crime qui menacent d’anéantir le monde.
Taichi Tanaka est un Japonais ordinaire qui vient de se créer un personnage, "Earth", dans un tout nouveau jeu VRMMO appelé "One More Free Life Online" et promettant un champ d’action quasi-illimité. Dans un monde où les joueurs sont libres de défier les monstres de toutes leurs forces ou de partir tranquillement à l'aventure, Taichi choisit de maîtriser les compétences les plus inutiles que le jeu puisse offrir ! Parfois, il fabrique des potions trop compliquées ou des plats dont le goût est bien meilleur qu'il n'y paraît. D’autres fois, il va chasser des monstres avec des armes farfelues fabriquées à la main... Bref, un gars ordinaire est sur le point de commencer sa propre vie dans cet univers de fantasy !
Bienvenue à Kura, une organisation qui enquête sur des crimes en utilisant le Mizuhanome, un système percevant l'envie de tuer. Rencontrez Sakaido, un détective brillant qui pilote ce système. Pour résoudre les mystères, il pénètre dans le monde de l'inconscient des meurtriers : le puits de ça, généré à partir de leur envie de tuer. Dans l'ombre de brutales et énigmatiques affaires rôde John Walker, un tueur en série particulièrement dangereux. Où sa traque emmènera-t-elle les enquêteurs ?