L'histoire commence dans un lycée où Makoto Ito est tombé amoureux d'une fille Kotonoha Katsura. Il la voit tous les jours dans le même train qu'ils prennent pour aller au lycée. Sekai Saionji, une amie qui est dans la même classe que Makoto, lui propose de l'aider, malgré ses sentiments pour lui...
Sawano a perdu son emploi à cause d'une dépression et n'est pas en bons termes avec sa femme et son fils de 6 ans. Après une tentative de suicide ratée, il découvre 7 lettres qui n'avaient pas été livrées et entreprend de les remettre à leurs destinataires, dans une sorte de compte à rebours jusqu'à la fin de sa vie.
Elizabeth Holmes, jeune et brillante, diplômée de l'université Stanford, tente de fonder une société de diagnostic ultra rapide à partir d'une simple goutte de sang et par un unique appareil. C'est une révolution. Mais c'est du bluff.
La série retrace l'affaire de Michael Peterson, un auteur de romans policiers accusé d’avoir tué sa femme Kathleen ainsi que la longue bataille judiciaire de 16 ans qui a suivi.
Kuzumi, étudiant fauché, renverse un jour à vélo un écrivain de romans érotiques, Kijima. Comme il n’a pas d’assurance pour payer les frais d’hôpital de Kijima et que celui-ci ne peut plus écrire ses manuscrits à la main, les deux hommes passent un marché : Kijima dictera ses textes à Kuzumi, qui les prendra en note pour lui.
Dark Blue Kiss poursuit l'histoire de Kiss Me Again et de Kiss The Series. Le couple formé par Pete et Kao est confronté à plusieurs problèmes. Si le père de Pete est désormais au courant de leur relation et les soutient, Kao n'a toujours pas fait son coming-out et redoute que sa mère découvre qu'il est homosexuel... Sans compter que le directeur de l'école où enseigne la mère de Kao a personnellement demandé à Kao de donner des leçons individualisées à son fils, Non. L'attitude ambiguë de Non vis-à-vis de son tuteur attise la jalousie de Pete, qui exige de Kao qu'il cesse de lui donner des leçons. Ces deux tempéraments de feu parviendront-ils à se mettre d'accord ? Sun, le propriétaire du café Blue Sky, se méfie de Mork, le meilleur ami de son frère Rain, le sachant enclin à la violence. Malgré tout, la fougue de Mork l'intrigue. Et lentement, les deux vont commencer à se rapprocher.