À la fin du 19ème siècle pendant l’ère Meiji, la nuit tombe au temple de Tenryuji à Kyoto. 292 guerriers se rassemblent, attirés par la promesse d’un grand prix de 100 milliards de yens. Parmi eux, Shujiro Saga entre dans ce jeu dangereux avec un seul but : sauver sa femme et son enfant malades.
Durant l'époque Sengoku, le Japon est divisé et les seigneurs féodaux se combattent sans cesse pour agrandir leur territoires. Les alliances se créent et se brisent, et des guerriers d'exception font leur apparition. Ainsi vont naître des rivalités légendaires entre Shingen Takeda et Kenshin Uesugi d'un côté, et les jeunes Yukimura Sanada et Masamune Date de l'autre. Ces hommes valeureux vont alors devoir faire face à un défi de taille : seront-ils capables de s'allier pour s'opposer à Nobunaga Oda ?
L'histoire suit Saniwa qui possède le pouvoir de donner vie aux objets. Afin de lutter contre des forces maléfiques qui tentent de réécrire l'Histoire, Saniwa entreprend un voyage à travers les époques pour retrouver des épées historiques japonaises, auxquelles elle donne une vie et une apparence humaine.
En l'an 1600 au Japon, le seigneur Yoshii Toranaga lutte pour sa survie alors que ses ennemis du Conseil des régents se liguent contre lui, lorsqu'un mystérieux navire européen est retrouvé échoué dans un village de pêcheurs voisin.
La vie de la jeune Fû, serveuse dans un salon de thé, est bouleversée quand elle croise le chemin d’un vagabond un peu sauvage, Mugen, et d’un mystérieux rônin, Jin. Elle voit très vite en eux une échappatoire à sa vie morose et leur propose un marché alors qu’ils sont sur le point d’être exécutés par l’administrateur local : elle promet de leur sauver la vie s’ils acceptent de voyager à ses côtés pour retrouver le mystérieux « samouraï qui sent le tournesol ».