l s'agit d'une nouvelle adaptation du manga Haikara-san ga Tooru de Yamato Waki. 1920, empire du Japon. Hanamura Benio, dix-sept ans, est un brin garçon manqué et a également appris les arts martiaux. Elle veut absolument s'éloigner des traditions qu'elle trouve désuètes. Cette envie de liberté se traduit notamment par le fait que celle-ci désire épouser un homme de son choix et non pas imposé par sa famille. Son père décide alors de la fiancer au sous-lieutenant Ijuuin, un militaire, dont les deux familles ont fait la promesse de se réunir. Benio refuse et décide avec l'aide de son ami d'enfance Ranmaru de tout faire pour déplaire aux parents de ce dernier.
Yoshioka Futaba, lycéenne un peu effacée, retrouve par hasard dans son école son premier amour du collège, Tanaka Ko. Celui-ci, qui après le divorce de ses parents avait suivi sa mère à Nagasaki, vient en effet d'être transféré dans son lycée. Mais Ko qui a repris le nom de sa mère et s'appelle donc désormais Mabuchi n'a pas que changé de nom, il a aussi changé de caractère et Futaba ne reconnait pas forcément celui dont elle était tombée amoureuse il y a quatre ans. Cependant en devenant tous les deux délégués de leur classe avec leurs amis Shuko, Kominato et Yuri, Futabe et Ko vont de nouveau se rapprocher. La parenthèse de quatre ans de Ko à Nagasaki reste malgré tout un mur entre eux jusqu'à ce que Futaba découvre un peu du passé de Ko.
Aux quatre coins du monde, pendant leur sommeil, des enfants se font kidnapper. Ils sont hypnotisés par une étrange musique qui les conduit tout droit au siège de Queen Badiane, le château Massepain. Là, la méchante reine, aidée de ses quatre sbires Perle, Poupelin, Banane et Orangeat, endort à jamais les enfants, dont les rêves sucrés alimentent le gouffre des cauchemars. Cet étrange trou noir grandit de nuit en nuit, prêt à tout instant à avaler la Terre tout entière...
Alors que la révolte gronde, Marie-Antoinette et sa protectrice Oscar François de Jarjayes doivent tracer leur propre voie en tant que femmes aux destins contrastés.
Sakura vient de capturer la carte Arrow (la Flèche). Peu de temps après, Sakura joue à une loterie et gagne un voyage à Hong-Kong pendant les vacances. Son père ne pouvant aller avec elle à cause de son travail, Sakura décide d'y aller avec Tiffany, Mathieu et son frère Thomas (n'oublions pas aussi Keroberos). Arrivée à destination, Sakura perçoit une aura maléfique. D’autre part, Shaolan (Lionel) est retourné avec Meiling (Stéphanie) à Hong-Kong pour les vacances. Shaolan perçoit lui aussi l'aura maléfique qui provient d'un puit. Il se trouve aussi que les cartes de Clow ont été créées à Hong-Kong et que quelqu'un cherche à se venger de Clow…
Dans un parc d'attraction en construction, Sakura et Tiffany rencontrent Lionel et Stephanie. Sakura, n'ayant pu déclarer sa flamme à Lionel essaye a plusieurs tentatives. Pendant ce temps, sans que Sakura s'en aperçoive, les Cartes de Clow disparaissent une à une, aspirées par la Carte du Néant, la dernière carte que Sakura n'a pas encore capturée. Cette carte a une force égale à toutes les autres Cartes de Clow réunies. Clow Reed l'a créé pour répondre à la loi du yin et du yang, toutes les cartes sont chargées d'un pouvoir positif sauf celle-ci, qui est chargée de maintenir l'équilibre. Cette carte a aussi le pouvoir de faire disparaître toutes choses ayant un rapport avec Sakura : des objets ou même des personnes...
L'histoire se centre sur deux lycéennes qui ont deux visions très différentes de l'amour : Yuna est une fille rêveuse et romantique, Akari est quant à elle plus réaliste. Il y a aussi deux jeunes hommes partageant une vision de l'amour différente : Kazuomi Inui, un ami de Yuna un peu tête en l'air qui ne comprend pas le concept de l'amour et Rio, le demi-frère d'Akari, qui accepte de sortir avec n'importe quelle fille tant que cette dernière est mignonne. Les choses évoluent lorsque Yuna tombe sous le charme de Rio et Akari celui de Kazuomi. Comment vont se dérouler leurs années de lycée malgré leurs visions de l'amour tant opposées ?