Food, Inc. décortique les rouages d'une industrie qui altère chaque jour notre environnement et notre santé. Des immenses champs de maïs aux rayons colorés des supermarchés, en passant par des abattoirs insalubres, un journaliste mène l'enquête pour savoir comment est fabriqué ce que nous mettons dans nos assiettes. Derrière les étiquettes pastorales de "produits fermiers", il découvre avec beaucoup de difficulté le tableau bien peu bucolique que les lobbys agro-alimentaires tentent de cacher : conditions d'élevage et d'abattage du bétail désastreuses, collusion entre les industriels et les institutions de régulation, absence de scrupules environnementaux, scandales sanitaires... Éleveurs désespérés, experts indépendants, entrepreneurs intègres et défenseurs du droit des consommateurs esquissent, chacun à leur manière, le portrait d'une industrie qui sacrifie la qualité des produits et la santé de ses clients sur l'autel du rendement.
Chaque année, 600 à 800 agriculteurs français mettent fin à leur vie, parce qu'ils ont des dettes et ne voient plus d'issue. Christian Bergeon était l'un d'entre eux : en 1999, il s'est suicidé, à 45 ans. Son fils Edouard a réalisé un documentaire sur le traumatisme familial et a suivi Sébastien Itard, un agriculteur tout aussi touché. Ce film de confrontation, à la fois hommage, deuil et poursuite, brise le silence rural sur un drame social sans précédent. Pendant la période d'enregistrement d'un an et demi, Sébastien Itard a commis une tentative de suicide, ce qui souligne l'urgence du documentaire.
En Tunisie, Tahar, un agriculteur, se lance dans un projet ambitieux : faire surgir la vie au coeur du désert en y plantant une nouvelle palmeraie adaptée aux effets du changement climatique.